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【客戶文章】真菌ChIP-seq揭示鐮刀菌在小麥中的致病機理

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【客戶文章】真菌ChIP-seq揭示鐮刀菌在小麥中的致病機理

發布日期:2021-05-21 作者: 點擊:

Opposing functions of Fng1 and the Rpd3 HDAC complex in H4 acetylation in Fusarium graminearum

Fng1Rpd3 HDAC復合體在小麥鐮刀菌H4乙?;械南喾垂δ?/span>

發表時間:2020.11

期刊:Plos Genetics

IF5.174


FRUIT MEISHI
(文章思路)

圖片1.png

FRUIT MEISHI
(研究背景)

通常,組蛋白的高乙?;軌驅е氯旧|結構松弛和基因表達活躍,低乙?;瘎t導致染色質結構凝集和抑制基因轉錄。組蛋白乙?;绞怯山M蛋白乙酰轉移酶(HATs)和組蛋白去乙?;福?/span>HDAC)介導的。HATHDAC酶的平衡作用對正常的細胞功能和發育非常重要。大多數的HAT酶存在于多蛋白復合物中,允許酶在細胞中執行特定的功能。

出芽酵母菌中,組蛋白乙酰轉移酶Sas3Esa1分別是組蛋白H3核小體乙酰轉移酶(NuA3)和組蛋白H4核小體乙酰轉移酶(NuA4HAT復合物的催化亞基。Sas3是基因轉錄的一般激活因子,它對由Yng1、Eaf6和另外兩個蛋白組成的NuA3復合物的HAT活性和完整性都是必需的。與NuA3復合體相比,NuA4復合體更為復雜,由Esa1HAT和其他12種蛋白組成,并且ESA1是釀酒酵母唯一必需的HAT基因;在其他絲狀真菌中,ESA1同源基因也是一個必需基因。

 酵母NuA3NuA4復合物除了含有不同的HATs外,還具有兩個具有相似序列和結構的復合物特異性蛋白Yng1Yng2。這兩個蛋白與人腫瘤抑制因子ING1(生長抑制因子1)同源,并且分別是NuA3NuA4復合物的亞基。它們都具有一個NING結構域(PF12998)和一個CPHDplant homeodomainfinger結構域。Yng1能夠介導Sas3與核小體的相互作用,是NuA3 H3ac所必需的;而Yng2是釀酒酵母轉錄激活和DNA損傷應答所必需的。

禾谷鐮刀菌是鐮刀菌病的致病因子。一些研究表明,組蛋白乙?;诤坦如牭毒z生長、分化、繁殖、次生代謝和發病機制等方面發揮著重要作用。在禾谷鐮刀菌中,組蛋白乙酰轉移酶FgSas3對脫氧雪腐鐮刀菌醇(DON)的產生和小麥頭部感染的致病性至關重要。另外,與酵母菌ELP3GCN5同源的HAT基因也通過調控相關基因的表達而對真菌的發育和植物感染起到重要作用。但目前,對于生長抑制蛋白(ING蛋白)在組蛋白乙?;械淖饔眉捌渑cHAT復合物的關系在鐮刀菌中尚不清楚。

本研究旨在研究鐮刀菌中酵母Yng2的同源基因Fng1,揭示ING蛋白在真菌發病機制中的作用。


FRUIT MEISHI
(研究材料)

野生型菌株PH-1;FNG1、Fgrpd3、Fgsds3突變株;Fng1-GFP;FgSas3-Flag;FgEsa1-Flag;


FRUIT MEISHI
(研究技術)

Co-IP;ChIP-seq;qRT-PCR;RNA-seq

FRUIT MEISHI
(文章結果)

1、Fng1功能驗證結果

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2、ChIP結果展示

8.png


3、RNA-seq結果展示

RNA-seq.png

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本文網址:http://www.cvcfyouth.com/news/588.html

關鍵詞:ChIP,ChIP-seq,ChIP-qPCR

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